《[笔记] 寻找转录因子结合位点的工具》的评论

先生

先生 — Fri, 12 Jun 2009 06:32:09 +0000

你好，我是研究基因调控这一方面的，在你的文章中说到 transfac professional 是收费的，由于我们的科研经费少的很，我们应该怎么获得那些账号呢？我的邮箱：cdlynu2007@126.com 谢谢！

c

Tue, 28 Oct 2008 12:36:57 +0000

你好，我是做promoter的，如果你仔细阅读了promoter相关的文章会发现用transfac可以寻找到许多tf binding site，但是在别人的文章中明显只对其中的一小部分进行了进一步的验证，甚至有些文章中的tf是软件上无法得到的，我很想知道在如此众多的软件所得tf 位点中是如何刷选的。谢谢,望不吝赐教。我的邮箱：hsp70xj@gmail.com

匿名

匿名 — Tue, 23 Oct 2007 02:10:09 +0000

mr zhang,
你好，我最近才转到分子结构位点的这个课题，我有些问题想请教：
1.我也不清楚哪些国外科学家购买了，怎么索取啊？
2.motif 和 regular element 以及TFBS的区别在哪里？它们不应该是等价的吧？我的email:leapahead815@gmail.com,希望能够得到你的帮助，非常感谢。

zhang

zhang — Sun, 16 Jul 2006 10:32:40 +0000

sophie-ming，你好。
transfac的数据库分为免费的public和收费的professional。
transfac的public数据库版本是7.0，数据比较老。收费的transfac professional的版本估计快到9.0了。professional的费用大概是750USD，还是很贵的。
不过很多国外的科学家已经购买了，你若需要，可以试着向他们索取？
你有什么看法，欢迎回复，谢谢！

匿名

匿名 — Thu, 13 Jul 2006 05:52:05 +0000

你好，谢谢你给出的宝贵经验，我刚开始用transfac有些问题不明白想向你请教：如你所言，TFsearch可以用来预测输入核苷酸序列哪些可能是转录因子结合序列位点，但它的数据库比较老，我的目的其实就是这个，找序列中可能潜在的TF binding site，但在TRANSFAC数据库中具体不知道该从何处入手，会不会是只有购买的数据库才能完成此功能，请教。可以回我邮箱吗，sophie- ming@hotmail.com.先谢过了。