windows XP下安装BioPerl和TFBS模块笔记

1。安装Activeperl,一切选项默认即可。
2。安装GD模块。“开始”-->“运行”-->"ppm" install http://theoryx5.uwinnipeg.ca/ppms/GD.ppd
3。安装DBI模块。还是在ppm命令行下，运行"query DBI"检查是否已经安装DBI;如果没有安装，运行"s DBI"寻找DBI；找到后"install #"。#代表相应的编号 。
4。安装DBD-MySQL模块。"s DBD-MySQl"; "INSTALL #".
5。安装aceperl模块。"INSTALL ACEPERL"
6。编译安装PDL-2.4.1-win32-4.zip。从SF下载PDL，注意下载PDL的2.4.1的win32版本，最新版本可能安装不上。首先你应该有C编译器，VC6足够。解压后，在命令行状态下进入解压后的目录，运行：
perl Makefile.PL
nmake
nmake install
7。安装bioperl
ppm> rep add Bioperl http://bioperl.org/DIST
ppm> rep add Kobes http://theoryx5.uwinnipeg.ca/ppms
ppm> rep add Bribes http://www.Bribes.org/perl/ppm
search Bioperl
install #
8。编译安装TFBS-0.5.0.tar.gz.前提条件都满足了（关键是PDL），下载TFBS，编译安装之。
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